二者都是采取全日制攻读的方法，其不同主要有两点：

　　培养目的不同。专业学位是培养在某一专业(或职业)范围具备坚实的基础理论和宽广的专业常识，具备较强的解决实质问题的能力，可以承担专业技术或管理工作，具备好职业素养的高层次应用型专门人才。学术性学位硕士研究生则主如果培养学术研究人才。

　　培养方法不同。专业学位课程设置以实质应用为导向，以职业需要为目的，以综合素养和应用常识与能力的提升为核心。教学内容强调理论性与应用性课程的有机结合，突出案例剖析和实践研究;教学过程看重运用团队学习、案例剖析、现场研究、模拟练习等办法;重视培养学生研究实践问题的意识和能力。在具体的学习过程中，需要有为期至少半年(应届本科毕业生实践教学时间原则上不少于1年)的实践环节。而学术学位研究生的课程设置侧重于加大基础理论的学习，重点培养学生从事科学研究革新工作的能力和素质。